Compte tenu des missions spécifiques de l'IRD et de l'Ifremer, l'expertise au sein de l'unité EME peut être déclinée sous 4 formes :
participation aux procédures d'évaluation de l'état d'exploitation des ressources marines faites au sein des Organisations Régionales des Pêches (ORP)
contribution à la gestion responsable des pêcheries en interagissant avec les administrations, le secteur professionnel et les ONG
participation au rôle d'observation des écosystèmes marins et lagunaires subissant l'impact du changement global
valorisation des compétences techniques et du savoir faire scientifique de l'unité au cours des réflexions menées par d'autres institutions sur les grands enjeux scientifiques propres aux écosystèmes marins Méditerranéens et tropicaux.
Expertise auprès des ORP
Ces ORP sont légalement responsables sur le plan international de la conservation des ressources halieutiques dans les zones géographiques de leur juridiction, ainsi que de la collecte des statistiques de pêche et des recherches visant à cette conservation :
Commissions thonières internationales: ICCAT, IOTC Activités : suivi statistique des pêcheries thonières, européennes et des pays en voie de développement (PVD), des senneurs, canneurs, et palangriers (assuré par l'Observatoire thonier de l'IRD pour les pêcheries tropicales et par l'Ifremer pour les pêcheries dans les eaux françaises ou en Méditerranée ) ; évaluation des stocks de thons et des espèces assimilées ; quantification des prises accessoires et des rejets (pêcheries tropicales) ; suivi d'indicateurs standardisés ; estimation de l'accroissement de l'efficacité et de la sélectivité des engins de pêche ; biologie et écologie des thons et des poissons porte-épée ; montage et réalisation des projets de marquage-recapture et analyse des données ; coordination de groupes de travail et d'instances scientifiques
FAO et Commissions Régionales des pêches : CGPM, SWIOFC, SPFRMO, CIEM, COPACE, etc... Activités : évaluation des stocks exploités par les pêcheries artisanales et par la pêche chalutière ; SIG des systèmes d'exploitation ; biologie et écologie des espèces ; indicateurs écosystémiques des pêches ; coordination de groupes de travail et d'instances scientifiques